Berapa cepat boleh bermutasi coronavirus?

Coronavirus baru, seperti semua virus lain, bermutasi, atau mengalami perubahan kecil dalam genomnya. Kajian yang diterbitkan baru-baru ini mencadangkan bahawa coronavirus baru, SARS-CoV-2, telah berubah menjadi satu lagi dan satu strain kurang agresif. Tetapi pakar tidak yakin.

Para penyelidik mendapati jenis "L", yang mereka anggap jenis yang lebih agresif, dalam 70% sampel virus. Mereka juga mendapati bahawa kelazatan strain ini berkurangan selepas awal Januari. Jenis yang lebih umum sekarang ialah jenis "S" yang lebih tua, kerana "campur tangan manusia" seperti kuarantin mungkin telah mengurangkan keupayaan jenis "L" untuk menyebarkan, penyelidik menulis di dalam kertas.

Walau bagaimanapun, Nathan Grubaugh, ahli epidemiologi di Yale School of Public Health yang bukan sebahagian daripada kajian itu, berkata kesimpulan penulis adalah "spekulasi tulen." Untuk satu perkara, beliau berkata, mutasi pengarang kajian yang dirujuk sangat kecil - atas perintah beberapa nukleotida, blok bangunan asas gen, katanya. (SARS-CoV-2 adalah kira-kira 30,000 nukleotida panjang).

Perubahan-perubahan kecil ini mungkin tidak akan memberi impak besar, jika ada apa pun, mengenai fungsi virus itu, maka ia akan menjadi "tidak tepat" untuk mengatakan bahawa perbezaan ini bermakna ada strain yang berbeza, katanya. Di samping itu, penyelidik hanya memandang 103 kes. "Ia satu set sampel yang sangat kecil daripada jumlah populasi virus," kata Grubaugh kepada Live Science. Memandangkan mutasi bahawa virus yang menjalani seluruh dunia mengambil "jumlah usaha yang nontrivial dan kadangkala mengambil masa bertahun-tahun untuk disiapkan," katanya.

Ahli sains lain bersetuju. Penemuan bahawa coronavirus bermutasi menjadi dua strain dengan ketegangan L yang membawa kepada penyakit yang lebih teruk "kemungkinan besar artefak statistik," Richard Neher, ahli biologi dan ahli fizik di University of Basel di Switzerland, menulis di Twitter. Kesan statistik ini mungkin disebabkan oleh persampelan awal kumpulan L di Wuhan, menyebabkan kadar kes kematian yang lebih tinggi, katanya.

Apabila terdapat wabak tempatan yang semakin pesat, para saintis dengan cepat mencuba genom virus daripada pesakit, mengakibatkan overrepresentation beberapa varian virus, Neher menulis. Para penulis kertas mengakui bahawa data dalam kajian mereka adalah "masih sangat terhad" dan mereka perlu susulan dengan set data yang lebih besar untuk lebih memahami bagaimana virus itu berkembang, mereka menulis.

"Kita tidak perlu risau"

Mengetahui bahawa kertas itu akan keluar semasa wabak ini, Grubaugh menerbitkan ulasan dalam jurnal Nature Microbiology pada 18 Feb. dengan tajuk "Kita tidak perlu bimbang apabila virus bermutasi semasa wabak penyakit."

Perkataan mutasi "secara semulajadi menimbulkan kebimbangan mengenai perubahan yang tidak dijangka dan aneh," tulisnya. "Pada hakikatnya, mutasi adalah sebahagian daripada kitaran hayat virus dan jarang menjejaskan wabak secara dramatik." Virus RNA, atau yang mempunyai RNA sebagai bahan genetik utamanya bukan DNA, termasuk SARS-CoV-2, bermutasi terus dan tidak mempunyai mekanisme untuk memperbaiki "kesilapan" ini, seperti sel manusia, misalnya.

Tetapi kebanyakan mutasi ini menjejaskan virus. Jika mutasi tidak memberi manfaat kepada virus, ia biasanya dihapuskan melalui pemilihan semulajadi, mekanisme evolusi di mana organisme yang lebih baik disesuaikan dengan alam sekitar mereka cenderung untuk terus hidup. Mutasi lain dapat bertahan dan disematkan ke genom "purata" virus.

Biasanya, kod gen berganda untuk ciri-ciri seperti keterukan virus atau keupayaan untuk menghantar kepada orang lain, Grubaugh menulis. Jadi, kerana virus menjadi lebih teruk atau menghantar dengan lebih mudah, banyak gen perlu bermutasi. Walaupun kadar mutasi tinggi di kalangan virus secara amnya, ia adalah luar biasa untuk mencari virus yang mengubah cara penghantaran antara manusia ke atas skala masa yang singkat, dia menulis.

Jadi, apakah semua ini bermakna untuk pembangunan vaksin yang mungkin?

Virus ini "masih begitu genetik bahawa mutasi ini tidak boleh mengubah vaksin baru," kata Grubaugh. Ia "tidak mungkin pemaju perlu bimbang tentang perkara ini." Namun begitu vaksin itu keluar, virus itu dapat menyesuaikan diri dengannya dan mengembangkan rintangan, katanya, tetapi menganggap bahawa virus RNA lain - seperti yang menyebabkan campak, gondong dan demam kuning - tidak menimbulkan ketahanan terhadap vaksin, senario itu tidak mungkin.

Malah, mutasi ini membantu saintis meneliti langkah-langkah virus, kata Grubaugh.

Contohnya, sekumpulan penyelidik di Brazil baru-baru ini mengasingkan SARS-CoV-2 dari dua pesakit yang mengesahkan mempunyai COVID-19 dan menyusun genom lengkap kedua-dua sampel virus itu. Mereka mendapati bahawa bukan sahaja genom berbeza antara satu sama lain, tetapi mereka juga sangat berbeza daripada genom sampel virus yang disusun di Wuhan, China, para penyelidik menulis dalam laporan yang tidak ditinjau rakan-rakan tetapi diterbitkan di forum pada 28 Feb.

Coronavirus yang diambil dari satu pesakit di Brazil mempunyai genom yang mirip dengan virus yang dijangkiti di Jerman, dan virus dari pesakit kedua menyerupai coronavirus di United Kingdom. Itu bermakna kedua-dua pesakit itu dikaitkan dengan kes di Eropah tetapi tidak satu sama lain, kata Grubaugh.