Pada 4 Julai 2016, misi Juno mendirikan orbit di sekitar Musytari, menjadi kapal angkasa kedua dalam sejarah yang melakukannya (setelah penyelidikan Galileo). Sejak itu, probe berada dalam orbit 53,4 hari biasa (dikenali sebagai perijove), bergerak di antara kutub untuk mengelakkan tali radiasi terburuk. Pada asalnya, saintis misi Juno berharap dapat mengurangkan orbitnya ke kitaran 14 hari sehingga siasatan dapat membuat lebih banyak hantaran untuk mengumpulkan lebih banyak data.
Untuk melakukan ini, Juno dijadualkan melakukan pembakaran enjin pada 19 Oktober 2016, semasa melakukan manuver perijovian kedua. Malangnya, kesalahan teknikal menghalang perkara ini berlaku. Sejak itu, pasukan misi telah menumpukan data misi untuk menentukan apa yang salah dan jika mereka dapat melakukan pembakaran enjin di kemudian hari. Namun, pasukan misi kini telah membuat kesimpulan bahawa ini tidak akan dapat dilakukan.
Kesalahan teknikal yang menghalang penembakan berlaku beberapa minggu sebelum pembakaran mesin dijadualkan terjadi, dan dikesan ke dua injap helium enjin. Setelah sistem pendorong ditekan, injap memerlukan beberapa minit untuk dibuka - sedangkan injap hanya memerlukan beberapa saat semasa pembakaran enjin sebelumnya. Oleh kerana itu, para pemimpin misi memilih untuk menangguhkan penembakan sehingga mereka dapat memahami dengan lebih baik mengapa kesalahan itu terjadi.
Dan setelah mencurahkan data misi dari beberapa bulan terakhir dan melakukan pengiraan mengenai kemungkinan manuver, pasukan sains Juno membuat kesimpulan bahawa pembakaran enjin mungkin tidak produktif pada ketika ini. Seperti yang dijelaskan oleh Rick Nybakken, pengurus projek Juno di Jet Propulsion Laboratory (JPL) NASA dalam siaran akhbar NASA baru-baru ini:
"Semasa tinjauan menyeluruh, kami melihat beberapa senario yang akan menempatkan Juno dalam orbit jangka pendek, tetapi ada kebimbangan bahawa pembakaran enjin utama lain dapat mengakibatkan orbit yang kurang diinginkan. Intinya adalah kesan yang melambangkan risiko untuk menyelesaikan objektif sains Juno. "
Namun, ini bukanlah berita buruk bagi misi ini. Orbit perijove semasa mengambilnya dari satu tiang ke tiang yang lain, yang memungkinkannya melewati puncak awan pada jarak sekitar 4,100 km (2.600 mi) paling dekat. Pada jarak paling jauh, kapal angkasa mencapai jarak 8.1 juta km (5.0 juta mi) dari gergasi gas, yang menempatkannya jauh di luar orbit Callisto.
Semasa setiap hantaran, probe dapat memuncak di bawah awan tebal untuk mengetahui lebih lanjut mengenai atmosfer, struktur dalaman, magnetosfera, dan pembentukan planet ini. Dan sementara tempoh orbit 14 hari memungkinkannya melakukan 37 orbit sebelum misinya dijadualkan untuk menyelesaikannya, tempoh 53.4 hari yang sekarang akan memungkinkan lebih banyak maklumat dikumpulkan pada setiap hantaran.
Dan sebagaimana Thomas Zurbuchen, pentadbir bersekutu untuk Direktorat Misi Sains NASA di Washington, menyatakan:
"Juno sihat, instrumen sainsnya beroperasi sepenuhnya, dan data dan gambar yang kami terima tidak kurang hebatnya. Keputusan untuk mengabaikan kebakaran itu adalah tindakan yang tepat - memelihara aset berharga sehingga Juno dapat meneruskan perjalanan penemuannya yang menarik. "
Sementara itu, pasukan sains Juno masih menganalisis pulangan dari empat flybys Juno sebelumnya - yang masing-masing berlangsung pada 27 Ogos, 19 Oktober, 11 Disember, dan 2 Februari 2017. Dengan setiap lulus, lebih banyak maklumat terungkap mengenai medan magnet, aurorae, dan penampilan band. Manuver perijovia seterusnya akan berlangsung pada 27 Mac 2017, dan akan menghasilkan lebih banyak gambar dan data dikumpulkan.
Sebelum misi berakhir, kapal angkasa Juno juga akan menjelajahi magnetotail Jupiter, magnetosfera selatannya, dan magnetopausenya. Misi ini juga menjalankan program jangkauan dengan JunoCamnya, yang dibimbing dengan bantuan orang ramai. Orang bukan sahaja dapat memilih ciri mana yang mereka mahu digambarkan dengan setiap flyby, tetapi gambar ini dapat diakses oleh "saintis warganegara" dan ahli astronomi amatur.
Di bawah rancangan anggaran semasa, Juno akan terus beroperasi hingga Julai 2018, dengan melakukan 12 orbit sains. Pada ketika ini, melarang peluasan misi, siasatan akan di-orbit dan terbakar di atmosfer luar Musytari. Seperti dengan Galileo kapal angkasa, ini untuk mengelakkan kemungkinan berlakunya impak dan pencemaran biologi dengan salah satu bulan Musytari.
